Sequencher 5通過將最新的同行評議的NGS算法從命令行中引入到直觀的點擊界面中，從而授權(quán)了頂尖科學(xué)家。無論是執(zhí)行參考引導(dǎo)比對、從頭組裝、變異調(diào)用還是SNP分析，其中都有需要的工具來獲得結(jié)果。Sequencher已經(jīng)集成了全面的袖扣套件，用于深入轉(zhuǎn)錄分析和差異基因表達的RNA SEQ數(shù)據(jù)。序列分析器可以很容易地生成自定義的圖表和圖表，讓您在幾秒鐘內(nèi)發(fā)布已準備好的圖形，從而生成您的RNA SEQ數(shù)據(jù)的獨特可視化。本站提供
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破解教程
1、運行exe程序完成軟件安裝程序
2、點擊下一步，開始安裝軟件
3、打開軟件的安裝目錄，運行Stop RLM Server.bat停止服務(wù)
4、將crack文件夾中的6個文件復(fù)制到SequencherServer的安裝目錄中替換同名文件
5、打開軟件的安裝目錄，運行start RLM Server.bat啟動服務(wù)
6、啟動桌面快捷方式，在彈出的許可證選項中選擇第二項
7、點擊install license，瀏覽SequencherServer的目錄并且選中g(shù)enecodes.lic
8、成功激活軟件
功能簡介
1、SNP 檢測
使用 Sequencher 來進行比較對準以便鑒別和報告 SNP 以及突變。例如，調(diào)用第二峰..功能分析你的所有序列以尋找潛在的雜合子。你可以控制定義一個雜合子的嚴格度。你可以從一個雜合子跳到下一個，而僅僅需要在 Base View 里面按一下空格鍵。你還可以觀察一致及其參考序列的轉(zhuǎn)換。一致及其參考序列的區(qū)別會列在一個可導(dǎo)出的表格內(nèi)。參考序列確保從一個裝配到下一個裝配時，SNP 的數(shù)目保持一致。
2、序列裝配
軟件的裝配算法可以將你的 DNA 片斷快速而又準確的裝配起來。自覺的工具允許你在數(shù)秒內(nèi)就可以設(shè)置好參數(shù)并且調(diào)整它們。你完全可以不顧方向的裝配序列。該軟件會比較前端和反轉(zhuǎn)補體方向來裝配最可能的 Contig。
3、序列編輯
能夠給你足夠的信心認為一個序列是絕對正確的。你可以只觀察一個序列的色譜圖，你也可以從前端或反方向同時查看多個對齊的色譜圖。 在你的已對齊數(shù)據(jù)中滾動是很容易的。你可以使用他的選擇工具來高亮不一致或者低質(zhì)量的區(qū)域。
4、自動分析
可對你的數(shù)據(jù)進行批處理，這個過程是透明、用戶可定義、可恢復(fù)的，并且從不為了自動化的目的而破壞你科學(xué)結(jié)論的正確性。
當你工作在多個序列時可以：
（1）調(diào)用第二峰
（2）調(diào)整矢量
（3）調(diào)整低質(zhì)量的尾端
（4）創(chuàng)建一致序列
（5）恢復(fù)到實驗數(shù)據(jù)
總是管理兩份數(shù)據(jù)，一份編輯過的，一份則是原始的導(dǎo)入數(shù)據(jù)。當你應(yīng)用“Revert to Experimental Data”命令到在你項目中已選定的序列或者在一序列中的選中部分時，你可以撤銷所有或者部分編輯動作。
（6）自從 4.5 以后就包含了一個新的自動化工具，“Assemble by Name”。依靠“Assemble by Name”，你可以選擇片段名的一部分作為一個共享的標識符，或者說是“裝配句柄”。Sequencher 就可以將選擇和名字自動轉(zhuǎn)換為 Contig。例如，僅僅通過一個按鈕的點擊，你就可以將 90 個文件，45對前端和反向序列轉(zhuǎn)換成 45 個根據(jù)你的病人編號命名的 Contig。裝配參數(shù)的每個變化都會重組你的片段，因此你可以根據(jù)克隆編號、日期、引物，或者其他任何你記錄在序列名稱中的特征，來裝配 Contig。
5、矢量調(diào)整
自動排序器以基礎(chǔ)調(diào)用錯誤生成結(jié)果。從 DNA 庫克隆的序列通常包括矢量序列、polyA 尾，或其他不相關(guān)序列。內(nèi)含子和引物序列通常會和放大的外顯子序列側(cè)面相連。不調(diào)整的話，這些污染物會扭曲你的裝配和下游分析。軟件允許你調(diào)整低質(zhì)量或者含糊的數(shù)據(jù)?！癟rim Ends”將令人誤解的數(shù)據(jù)從序列片段的尾部去除?！癟rim Vector”將污染序列尾部的特定序列數(shù)據(jù)移除。“Trim to Reference”剔除超出裝配參考序列的序列尾部。
更新日志
V5.4.6
所有DNA序列分析的新的和增強的特征：
1、將引物序列從引物爆炸序列中發(fā)送到序列分析儀項目中。
2、容易地使用項目序列中的一致序列作為混合測序項目NGS比對的參考序列。
3、新批恢復(fù)修剪結(jié)束命令。
4、在項目窗口中調(diào)整字體大小的能力。
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